乙肝DNA病毒如何改变3D基因组？法国研究员提供，靶向药新见解

　　在细胞核内转录其DNA的病毒，必须适应控制转录调控的现有细胞机制。最近的技术有所突破，并突出了细胞基因组的高度分层组织及其在基因表达调控中的作用。

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　　来自Viruses：法国巴斯德研究所等研究人员发表题为乙肝病毒与3D基因组结构之间的串扰

　　乙肝DNA病毒如何改变3D基因组？法国研究人员提供，靶向药新见解

　　在科学杂志《Viruses》上，研究人员提供了有关乙肝病毒如何与 3D基因组相互作用及其对病毒和细胞基因表达影响的最新知识，还探索了其他DNA病毒药物开发策略。

　　结果表明，HBV整合属于早期感染常见事件。整合的HBV基因组无法复制，但被认为以多种方式促进HCC发展。已在大多数HBV相关HCC（70-90% 的 HCC）中发现了整合的HBV序列，并且通常是克隆或寡克隆的。这些整合的序列，可能负责插入诱变和或基因组重排。然而，只有少数研究旨在正确破译导致HBV整合后细胞基因失调的机制。

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　　来自科学杂志《Viruses》：图 2. HBV与3D基因组相互作用的图形总结

　　在本研究中，研究人员发现HBV与其他病毒一样，利用 3D基因组组织进行自身转录。然而，需要进一步的研究来了解病毒是如何在这些染色体位点非随机定位，以及这些空间定位的破坏是否会导致其沉默甚至消除。此外，HBV不仅利用基因组折叠进行自身转录，而且研究人员还观察到病毒DNA接触至少受HBV感染的原代人类肝细胞中，会干扰细胞基因的表达。

　　虽然，以上发现需要在体内才能够得到进一步证实，但它可能有助于细胞转化。研究人员还观察到转录沉默的病毒，例如HBV X-，仍然与细胞染色质建立联系。尽管HBV接触的区域，在两项研究之间有所不同，这可能是由于每个细胞的cccDNA分子数量可能会改变HBV/宿主DNA接触的分布，但在评估转录沉默的cccDNA是否会影响细胞仍然很重要，并通过DNA/DNA接触的基因表达和表观遗传调控。

　　因此，本研究人员认为，如果沉默的cccDNA分子仍然与宿主染色质建立联系，那么旨在沉默HBV cccDNA的慢性携带者的治疗方法可能无法消除HCC发生的全部风险，这可能导致与癌症发展相关的基因失调。

　　最后，由于病毒DNA整合发生在基因表达和基因组 3D组织紧密联系并相互影响的背景下，因此，在 3D基因组组织的背景下探索HBV诱导的HCC。对癌症中3D基因组破坏的研究正在取得进展，研究DNA病毒是如何改变 3D基因组组织将有助于更好地了解 3D结构失调如何促进肿瘤发生。破译HBV整合后肝细胞转化的分子机制，可能为合理开发靶向药物带来有用的见解。

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　　小番健康结语：我们简单梳理一下研究人员观点。研究人员深入探索了HBV怎样和细胞 3D基因组相互作用，结果发现，感染野生型病毒 (HBVwt) 的细胞中的 HBV cccDNA 优先与活性染色质和区室A 基因组区域相关；HBV 缺乏转录调节因子 HBx (HBV x-) 的表达，被转录抑制并与 SMC5/6 复合物相关，并优先与异染色质和区室 B 基因组区域相互作用。

　　HBV接触反过来会干扰细胞基因调控，并可能导致宿主基因的上调或下调。本研究由法国蒙彼利埃大学人类遗传学研究所、法国巴斯德研究所研究人员发表在科学杂志《Viruses》上。

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